厄爾尼諾指數進入下降區間：2020年9月18日晚報厄爾尼諾指數進入下降區間：2020年9月18日晚報楊學祥， 楊冬紅 關鍵提示： 潮汐組合類型轉換具有13.6天週期，即雙週循環，01-2中都有明顯的表現。晚除此之外，兩週之內厄爾尼諾指數往往出現兩個峰值和兩個谷值，

桃園彩券行

即次一級的7天週期。這一 週期在氣溫變化中也有明顯的表現（見圖）。 潮汐不僅有13.6天週期，而且存在7.1天和9.1天週期。1921年杜德生對月亮和太陽引潮力位進行了嚴格的調和級數展開，在展開中約有90項長週期成分。其中振幅超過這90項長週期振幅之和的0.5%的共有20個，在這20個中就有9天項和7天項（見圖1）。圖1 2020年月17日18時厄爾尼諾指數為-0.704，比9月17日12時厄爾尼諾指數為-0.698，減速0.006，減速變快，進入下降區間。圖2 2020年月18日00時厄爾尼諾指數為-0.713，比9月17日18時厄爾尼諾指數為-0.704，減速0.009，減速變快，進入下降區間。 9月2日18時厄爾尼諾指數為-0.706 進入谷值。9月5日00時厄爾尼諾指數為-0.661進入峰值。9月6日12時厄爾尼諾指數為-0.690進入谷值。9月10日00時厄爾尼諾指數為-0.733進入谷值。9月17日00時厄爾尼諾指數為-0.694進入峰值。 2020年2月南極啊i海冰面積達到極小值，德雷克海峽通道擴大導致秘魯寒流減弱，厄爾尼諾指數處于較高值；此後南極海冰面積不斷增大，將在9月達到最大值，使厄爾尼諾指數快速下降。強潮汐加快了這一進程。http://blog.sciencenet.cn/blog-2277-1241894.htmlhttp://blog.sciencenet.cn/blog-2277-1235992.htmlhttp://blog.sciencenet.cn/blog-2277-1232152.html圖3 南極海冰增加趨勢和白令海峽熱異常對比：2019年8月5日和2020年9月15日（白色為海冰，紅色為熱異常）對比。2019年8月5日和2020年9月15日南極半島海冰比較：2020年8月南極半島海冰快速增大是赤道東太平洋海溫下降的主因。 2020年9月潮汐組合預報：強潮汐時期已有 1560 次閱讀 2020-1-7 10:55 |個人分類:全球變化|系統分類:論文交流| 潮汐組合錛 潮汐預警錛 日月大潮錛 近地潮錛 月亮赤緯角2020年9月潮汐組合預報：強潮汐時期吉林大學:楊學祥錛楊冬紅 中科院國家天文台:韓延本錛馬利華 2020年2-5月、9-12月為強潮汐時期，1月、6-8月為弱潮汐時期。6-8月弱潮汐時期導致潮汐南北震蕩減弱，有利于長江巨洪的發生，與1998年相似。 潮汐組合A：9月5日為月亮赤緯角最小值北緯0.0001度，9月2日為日月大潮，9月6日為月亮遠地潮，三者弱疊加，潮汐強度大，地球扁率變大，自轉變慢，有利于拉尼娜發展（最強），潮汐使兩極空氣向赤道流動，可激發地震火山活動和冷空氣活動（強）。潮汐組合B： 9月12日為月亮赤緯角最大值南緯24.2122度，9月10日為日月小潮，兩者強疊加，潮汐強度小，地球扁率變小，地球自轉變快，有利于厄爾尼諾發展（弱），潮汐使赤道空氣向兩極流動，可激發地震火山活動和暖空氣活動，有利于低層偏南風的發展，帶來較多水汽，

男生內褲

造成部分地方出現大霧天氣（弱）。潮汐組合C：9月18日為月亮赤緯角最小值南緯0.0000度，9月17日為日月大潮，9月18日為月亮近地潮，三者強疊加，潮汐強度最大，地球扁率變大，地球自轉變慢，有利于拉尼娜發展（最強），潮汐使兩極空氣向赤道流動，可激發地震火山活動和冷空氣活動（最強）。潮汐組合D： 9月25日為月亮赤緯角最大值南緯24.2735度，9月24日為日月小潮，兩者強疊加，潮汐強度小，地球扁率變小，地球自轉變快，有利于厄爾尼諾發展（弱），潮汐使赤道空氣向兩極流動，

大樂透開獎查詢

可激發地震火山活動和暖空氣活動，有利于低層偏南風的發展，帶來較多水汽，造成部分地方出現大霧天氣（弱）。本月天文奇點相對較集中，相互作用最強，可激發極端事件發生，地震火山活動進入活躍期。http://blog.sciencenet.cn/blog-2277-1213209.htmlMicrobiome：地球上有多大比例的原核生物已經被測序了基因組？Estimate of the sequenced proportion of the global prokaryotic genomeArticle，2020-09-16Microbiome錛 [IF 11.607]DOI：https://doi.org/10.1186/s40168-020-00903-z視頻摘要：https://watch.wibbitz.com/preview/?id=b5cf250363a52433baa5e8783fa07cf03&next=none第一作者：Zheng Zhang（張正），Jianing Wang（王家寧）通訊作者：Yuezhong Li（李越中，lilab@sdu.edu.cn），Zheng Zhang（張正，zhangzheng@sdu.edu.cn）合作作者：Jinlan Wang（王金蘭），Jingjing Wang（王晶晶）主要單位：山東大學微生物技術國家重點實驗室（State Key Laboratory of Microbial Technology錛 Institute of Microbial Technology錛 Shandong University錛 Qingdao 266237錛 China）；山東大學蘇州研究院（Suzhou Research Institute錛 Shandong University錛 Suzhou 215123錛 China）；導讀地球微生物組是一個巨大的微生物資源庫，長期以來的1%可培養微生物在最近很多場合被大家拿出來表示質疑。但目前我們空間獲得了多少微生物的基因組呢？本文通過基因組數據的收集整合，

男生內褲

推測這一比例至少為2%，但即使是這樣，這也是一個比較小和保守的估計。其次本文通過地球微生物組項目和微生物基因組數據的比對，展示了地球微生物組中原核生物基因組的測序現狀。從數據規模上來看，

小昆凌

這一統計來源于1萬個EMP的數據，15萬個測序的參考基因組，加上從1500多個宏基因組樣本中bin出來的7千多個基因草圖。通過評估已有參考基因組的OTU或者物種在環境微生物群落中佔比，文中定義指標POTU：代表已有基因組的OTU在微生物群落中的比例。帶著這兩個前提，大家請欣賞本文，

淘金娛樂城ptt

很有意思的工作，而且後面我覺得無論是數據量還是分析指標上都可以繼續開展許多工作，微生物組研究的黃金時代才剛剛開始。摘要基因組測序提供了描繪原核生物進化和功能多樣性的藍圖，深刻改變了我們對原核生物如何與其他原核生物、宿主以及週圍環境相互作用的理解。然而，對于地球上有多大比例的細菌和古菌已經被測序了基因組這個基本問題，目前卻仍不清楚。在本研究中，通過對地球微生物組計劃數據和公共數據庫中原核生物基因組信息的大規模比對，

男生內褲

我們首次給出了答案。目前在地球上主要的原核生物群落中，已知基因組信息的細胞或類群佔比的中位數已經分別達到38.1%（16.4%-86.3%）和18.8%（9.1%-52.6%）。原核生物群落基因組測序比例與其α多樣性顯著負相關，並且宿主依賴類環境的測序比例顯著高于自由生活類環境。由于廣布類群已知基因組信息的程度更高且仍存在大量低測序比例的稀有類群，全球原核生物類群整體上的基因組測序比例實際上僅有2.1%。少數高豐度的優勢類群佔據群落主體，其基因組測序比例也遠高于數量龐大的稀有類群。這些結果首次全景展示了地球微生物組中原核生物的基因組測序狀況，將有助于在未來更加合理高效的挖掘基因組資源。視頻摘要：https://v.qq.com/s/videoplus/152947859引言原核生物是地球上最古老、最廣泛的生命形式，生活在幾乎所有的生態系統中，是地球元素循環的主要推動者。基因組測序提供了描繪原核生物進化和功能多樣性的藍圖，深刻改變了我們對原核生物如何與其他原核生物、宿主以及週圍環境相互作用的理解。那麼，目前地球上有多大比例的細菌和古菌細胞或類群已經測序了基因組？這個看似簡單和基礎的問題卻從未被解答。自從1995年第一個完整的細菌基因組發布以來，原核生物的測序速度隨著技術發展和成本降低而飛速上升，

桃園彩券行

目前在公共數據庫中具有完整或草圖序列的細菌和古菌基因組已超過20萬個。同時，測序通量和計算技術的進步已經可以利用分箱(binning)從宏基因組數據中獲得不依賴培養的宏基因組組裝基因組(metagenome-assembled genomes錛 MAGs)，這進一步加速了對原核生物基因組信息的挖掘。而與基因組數據的指數級積累相反，最新估計的全球原核生物多樣性僅為80-160萬個OTU，遠低于之前預測的上萬億個。因此，現在已有必要全面評估全球原核生物的基因組測序狀況。地球微生物組計劃（Earth Microbiome Project，EMP）以前所未有的規模對地球微生物群落進行採樣，用以評估原核生物在全球環境中的分布方式。在本研究中，通過對EMP公布的首批數據和公共數據庫中的原核生物基因組信息的大規模比對，我們第一次全景展示了地球微生物組中原核生物基因組的測序現狀。結果通過對EMP序列數據和近16萬個RefSeq基因組信息的比對，我們評估了已知基因組信息的細胞或類群在特定原核生物群落中的比例（Bcell和BOTU）。結果顯示，在16S rRNA序列完全一致的前提下，被研究的1萬個樣本的Bcell值中位數已達38.1%，上四分位數和下四分位數分別為16.4%和86.3%（圖1）。這意味著在超過一半的原核生物群落中，至少有38%的細胞的基因組信息已經被報告了。類似的，對于BOTU值，其中位數也達到了18.8%（9.1%-52.6%）。並且，原核生物群落中已知基因組信息的比例與其所處環境密切相關，宿主依賴類環境的基因組測序程度顯著高于自由生活類環境。原核生物群落的測序比例還與其α多樣性呈現顯著負相關性。具有低α多樣性的原核生物群落往往具有較高的基因組測序程度，在細胞和類群水平上均是如此。圖1.原核生物群落中已知基因組信息的程度(A) 群落中已測序細胞的比例。(B) 群落中已測序類群的比例。紅色代表樣品來自宿主依賴類環境，綠色代表來自自由生活類環境。基于多個樣本Meta分析得到的OTU的基因組測序比例被定義為POTU值。對1萬個EMP樣本的Meta分析共聚類到262011個OTU，以16S rRNA序列完全一致為標準，我們發現其中已知基因組信息的OTU僅佔2.1%。原核生物類群能夠生存的樣本或環境類型越多，其已知基因組信息的幾率越高（圖2）。由于生活于多個群落的廣布類群已知基因組信息的程度更高，而大量窄布/稀有類群的測序比例仍很低，導致了POTU值總是低于相應的BOTU值。圖2.原核生物廣布類群已知基因組信息的程度更高，導致POTU值遠小于BOTU值因為一個OTU有可能出現在多個樣本中，所以我們通過隨機抽樣評估了樣本數量對OTU值的影響（圖3）。結果顯示，隨著樣本數量增加，POTU值呈現指數衰減趨勢，並最終穩定在2.13%±0.03%。因此，基于1萬個EMP樣本估計的POTU值已經非常接近全球所有原核生物類群中已知基因組信息的比例了。基于全部宿主依賴類環境樣本計算的POTU值為4.6%，而全部自由生活類環境樣本的P OTU 值則僅有2.1%。總之，盡管原核生物基因組信息在快速積累，但目前全球原核生物類群整體上的基因組測序比例仍然很低。圖3.全球原核生物類群的基因組測序比例仍很低豐度最高的前1%的原核生物類群佔了全球原核生物群落總豐度的超過70%，並且在各種環境類型中均是如此（圖4）。我們發現，豐度最高的前1%的原核生物類群中已經有高達38.0%被報告了基因組序列，而在佔比59.8%的低豐度類群（總序列數不超過10條）中則僅有0.6%已知基因組信息。因此，具有高基因組測序程度的少數優勢類群佔據了全球原核群落主體。圖4.原核生物高豐度類群已知基因組信息的程度更高我們估計了原核生物在門綱目科屬各個分類水平的基因組測序程度（補充數據）。P OTU 值在不同類群間差異巨大，而同一類群的P OTU 值在環境間也有明顯差別。此外，RefSeq基因組全部來自已培養菌株，而數據庫中也已有大量基于宏基因組分箱獲得的未培養細菌和古菌的基因組(MAG)。利用這些MAG，我們評估了菌株可培養性對目前基因組測序偏好的影響。結果顯示，可培養性影響物種間的基因組測序偏好但不影響環境間差異。討論基因組是了解原核生物生理、生態和進化的基本資源。在這個工作中，我們首次全面評估了全球原核生物基因組測序的現狀。目前地球上多數原核生物群落的基因組測序程度已經比較高了，在細胞水平這個比例的中位數已經達到38.1%（16.4%-86.3%），在類群水平也有18.8%（9.1%-52.6%）。因此，當我們關注一個具體的原核生物群落時，這個群落的遺傳信息可能已經在相當高的程度上被展示了。然而，與群落的情況不同，全球原核生物類群在整體上的基因組測序比例仍然很低。我們估計，目前所有原核生物類群中僅有2.1%已被報告了基因組信息。由于原核生物基因組測序目前仍集中于少數廣布類群和高豐度類群，對于大量稀有類群基因組信息的了解尚非常有限，對這個巨大遺傳資源的挖掘工作其實才剛剛開始。原核生物僅有1%可培養的說法對微生物生態學產生了深遠影響，但在最近產生爭論，詳見三篇ISME的討論 。因為RefSeq基因組數據基本全部來自已培養類群，而相當比例的可培養類群尚未測序基因組，所以我們估計全球原核生物類群的可培養率應高于2.1%的基因組測序比例。而與高豐度優勢類群具有更高的基因組測序比例相似，優勢類群也應具有比稀有類群高的多的可培養率，所以原核生物細胞水平的可培養率也會大大高于類群水平。因此，我們認為不論對于類群還是細胞，原核生物僅有1%可培養的說法都已經過時了。作者簡介張正，山東大學微生物技術研究院副研究員，微生物技術國家重點實驗室“藥源微生物基礎和應用創新團隊”成員。從事微生物學和生物信息學研究多年，作為第一作者或通訊作者在Molecular Biology and Evolution、Microbiome、Nucleic Acids Research等雜志上發表SCI論文15篇。王家寧，山東大學微生物技術研究院博士研究生，微生物技術國家重點實驗室“藥源微生物基礎和應用創新團隊”成員。目前主要研究方向是環境微生物組。作為第一作者或共同第一作者在Microbiome、Journal of Hazardous Materials、mSystems、International Biodeterioration and Biodegradation等雜志上發表研究論文5篇。李越中，山東大學微生物技術研究院教授，博士生導師，國家傑出青年基金獲得者，微生物技術國家重點實驗室“藥源微生物基礎和應用創新團隊”PI。長期致力于重要藥源微生物相關的基礎和應用基礎研究，作為通訊作者在ISME、Microbiome、mSystems等雜志上發表研究論文100餘篇，獲得國家發明專利10餘項、國際專利2項。作者主頁：http://www.mbtechinst.qd.sdu.edu.cn/info/1040/1707.htm博士後招聘：https://q.eqxiu.com/s/VVq1Mybr參考文獻Zheng Zhang錛 Jianing Wang錛 Jinlan Wang錛 Jingjing Wang & Yuezhong Li. (2020). Estimate of the sequenced proportion of the global prokaryotic genome. Microbiome 8錛 134錛 doi: https://doi.org/10.1186/s40168-020-00903-z編譯：王家寧 山東大學責編：五谷雜糧 南農審核：劉永鑫 中科院**猜你喜歡10000+: 菌群分析寶寶與貓狗 提DNA發Nature 實驗分析誰對結果影響大Cell微生物專刊 腸道指揮大腦系列教程：微生物組入門 Biostar 微生物組宏基因組 專業技能：生信寶典 學術圖表 高分文章 不可或缺的人 一文讀懂：宏基因組 寄生蟲益處 進化樹必備技能：提問 搜索Endnote文獻閱讀 熱心腸 SemanticScholar Geenmedical擴增子分析：圖表解讀 分析流程 統計繪圖 16S功能預測 PICRUStFAPROTAXBugbase Tax4Fun在線工具：16S預測培養基 生信繪圖科研經驗：雲筆記雲協作 公眾號編程模板: ShellR Perl 生物科普: 腸道細菌 人體上的生命 生命大躍進細胞暗戰 人體奧秘寫在後面為鼓勵讀者交流、快速解決科研困難，我們建立了“宏基因組”專業討論群，目前己有國內外5000+ 一線科研人員加入。參與討論，獲得專業解答，歡迎分享此文至朋友圈，並掃碼加主編好友帶你入群，務必備注“姓名-單位-研究方向-職稱/年級”。技術問題尋求幫助，首先閱讀《如何優雅的提問》學習解決問題思路，仍末解決群內討論，問題不私聊，幫助同行。學習擴增子、宏基因組科研思路和分析實戰，關注“宏基因組”點擊閱讀原文，

MLB奧克蘭運動家

跳轉最新文章目錄閱讀https://mp.weixin.qq.com/s/5jQspEvH5_4Xmart22gjMA​，